לצמח המרפא הרב-תכליתי הזה יש גם תכונות נוגדות חמצון.
תרכובות הסולפהדריל (sulfhydryl) (גופרית ומימן) בשום הן "chelators" חזקים של מתכות כבדות רעילות, הנקשרות איתן כדי שניתן יהיה להפריש אותן. אותן תרכובות מהוות הגנה יעילה מפני חמצון ורדיקלים חופשיים וכך גם מונעים חמצון של מולקולות שומן שונות.
שום מכיל גם חומרים מזינים נוגדי חמצון כמו ויטמינים A ו-C וסלניום.
תמציות של שום טרי שיושנו לאורך תקופה ממושכת להפקת תמצית שום מיושן (aged garlic extract) מכילות פיטוכימיקלים נוגדי חמצון המונעים נזקי חמצון. אלה כוללים תרכובות אורגנו-גופריתיות ייחודיות מסיסות במים ומסיסים בשומנים ופלבנואידים, אליקסין וסלניום.
מחקרים על תמצית שום מיושן (AGE) הראו שתהליך ההזדקנות מגביר באופן משמעותי את פוטנציאל נוגד החמצון של השום. מגן מפני נזקי DNA, שומר על בריאות כלי הדם ושומר מפני נזקי קרינה ואור השמש.
תוספי שום מיושן מספקים ריכוז גדול יותר של תרכובות מועילות של שום, במיוחד כדי להפחית חמצון הקשור להזדקנות.יש בצורה חסרת ריח וחסרת טעם כגון תמצית שום מיושן Kyolic מוואקונאגה האמריקאית. תמצית שום מיושן מפחיתה את רמות הכולסטרול בדם, מספקת הגנה מפני מחלות לב על ידי מניעת קרישי דם.